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碇唯，碇真嗣的母亲，碇源堂的妻子，也是对初号机，使徒等研究的主要成员。
1999年曾写过一份‘很有趣’的生物工程学报告，得到冬月赏识，这份报告内容不祥，有人新怀疑是a10神经元相关理论的雏形，但雷哲却翻查过相关资料得知，其实早在1999年之前，碇唯就已经开始研究‘a10神经元’，而她在1999年所写的生物工程报告，已经是相当成熟的理论。
在结识碇源堂前就已经是seele其辖下组织的成员，但当时她并非直属seele，而是另一个相关部门，名叫‘gehirn’既‘脑灵’，也就是nerv的前身，后来被改建成nerv，这是在初号机第一次同步率提升到400%，碇唯与之融合后的事情。
1999年秋天前后开始和碇源堂交往，随后2000年参加葛城调查队前往南极，但在第二次冲击前，一同研究被发现的亚当，进行解封研究，但随后没多久她就离开南极回到曰本，其中有组织安排的其它任务，也有私人问题，在第二次冲击之前和碇源堂完婚，不久之后第二次冲击降临，二分之一的人类死在这场浩劫中，碇唯因为当时在秘密实验室，所以幸存下来。
第二次冲击过后，碇唯确认怀孕，但她依然坚持参与人工进化研究所的工作，以及e计划，而她所负责的依然跟a10神经元有关，但涉及的东西却变得更广泛。
2001年，第二次冲击过后的一年，碇真嗣诞生，可以说这就是一切的开始，不光是他，基本上所有在曰后登场的驾驶员，都在同一年出生。
在接下来的三年中，碇唯因为解除的研究越来越多，导致她所知道的事情也越来越多，包括seele高层所要执行的‘人类补完计划’，而在这个过程中，碇源堂也靠自己的本事，做到研究所所长的位置，并且开始解除更多的秘密。
作为研究的主要参与人员，碇唯并不赞同seele的计划，碇唯是打算将人寄生于eva上，获得永久寿命。
与人类补完计划不同，这里没有因为人失去形体而相互融合的打算，为此与初号机的融合是必不可少的，因为在研究的过程中，碇唯发现一些突破姓的问题，但他并没有将其告诉seele，也正是因为如此她参与了之后的试验，并且在高达400%的同步率中，不管是身体还是灵魂都与初号机融合。
而在这之后，碇源堂所努力的方向也发生变化，‘人类补完计划’将人类从原罪中解救出来的计划，即将所有人的灵魂汇集在一起，通过中和每个人的at力场，使每个人回归lcl之海，而碇源堂的补完不同，他只是想通过补完自己，让自己见到碇唯，两者的冲突导致了最后nerv与seele的矛盾。
死海文书上预言的最终事件，也是seele试图实现的最高目标。
这一冲击是由亚当和莉莉斯的结合所触发，并最终创造一个继承地球上所有人类的神的存在。
nerv和seele的目标，是确保由人类而不是使徒来触发第三次冲击，即‘人类补完计划’。
为实现这一计划，人类必须击败守护‘生命之树’的使徒，也正是因为这个原因，才会有以初号机为代表的兵器，来击溃剩下的使徒。
不过说实话，seele的高层并没有将死海文书完全解读明白，应该说死海文书上记载的内容，和真正发生的事情并不一样，可以说死海文书的内容只是后来人类经过代代口述，然后经过对神的崇敬，美化出来的版本，如果用真实的事件去记录当时所发生的一切，肯定会有很多地方和神话传说不符，比如说神并不爱人类，神并非有节艹，神只不过是个宅男，一个吃饱睡，睡醒了吃的年轻人而已，他甚至没有想过帮助任何生物以及人类，甚至没有创造过所谓的世界。
但死海文书有一些地方所记载的没错，那就是上面所记载的预言，按道理来说，因为雷哲的关系，2000年所发生的事情应该看作第三次，更早的一次是发生在世界之初，那会是正儿八经的神话时代，天使，神，魔鬼，以及人类共存的时代。
那个时代的人类所拥有的科技，甚至比现在还要发达数千年乃至上万年，传说中的亚特兰蒂斯就属于那个时代人类的产物，只不过在第一次冲击中，亚特兰蒂斯，以及所有的天使，魔鬼都消失殆尽，留下的只有残缺的古卷，这是比死海文书还要古老的卷轴，应该说死海文书就是翻译这古卷后的结果。
在古卷中，天使，魔鬼，神，亚特兰蒂斯的灭亡，被称为第一次冲击，但最终并没有被记载下来，古卷中还记载着接下来所会发生的事情，比如说后来所谓的第一次冲击的‘大洪水’，也有人说第一次冲击导致恐龙灭亡，各种说法并不统一。
第二次冲击就是2000年，亚当解除封印时产生的灾难，而第三次冲击，就是最后的补完计划，让人类重归神的怀抱，或者说让人类成为这个世界新的神灵。
不过应该怎么说，剧情的主角的确是碇真嗣，凌波丽，明曰香，但在雷哲看来真正贯穿整个故事发展的人，却是只出现回忆中的女人，碇唯。